Die Mitglieder des Hochschulverbunds TRIO sind die OTH Regensburg (Verbundkoordination), die OTH Amberg-Weiden, die TH Deggendorf, die Hochschule Landshut und die Universität Passau (Wissenschaftliche Leitung). Die Universität Regensburg nimmt als Partnerin am TRIO-Projekt teil.
Die bereits seit Jahren aufgebaute und gefestigte Kooperation zwischen den Verbundhochschulen im Rahmen des Netzwerks Internet und Digitalisierung (INDIGO) bildet eine wichtige Grundlage von TRIO. INDIGO bündelt die (Forschungs-)Kompetenzen zahlreicher Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler aus verschiedenen Disziplinen der Verbundhochschulen. Das Netzwerk unterstützt die fachübergreifende Kooperation auf dem Gebiet der angewandten Forschung und Grundlagenforschung im Bereich Internet und Digitalisierung. Darüber hinaus bietet INDIGO verschiedene Maßnahmen zur Förderung des wissenschaftlichen Nachwuchses an.